水溶性壳聚糖溶液的性质对其应用有重要影响。水溶性壳聚糖溶液有其自身特性，也具有高分子化合物溶液的通性。水溶性壳聚糖不溶于水、碱以及一般有机溶剂，但是因为水溶性壳聚糖结构单元中存在- NH2基团，较易与酸反应成盐，因此，水溶性壳聚糖可以溶解在盐酸、甲酸、乙酸、乳酸、苹果酸、抗坏血酸等许多稀的无机酸或某共有机酸中，长时间加热搅拌条件下也能溶解在浓的盐酸、硝酸、磷酸中。
　　水溶性壳聚糖溶液的表面能先随着溶度参数较大而减小，然后迅速上升。水溶性壳聚糖和甲壳素的解离性能与脱乙酰度的变化关系不是很大。水溶性壳聚糖的解离常数pKa，与溶液中离子强度和种类有关。同一水溶性壳聚糖溶液，在相同水解时间下，水解产物的相对分子质量的倒数和温度呈正比关系。在0.1 mmol/L乙酸溶液中水溶性壳聚糖存在明显的白聚现象，随着水溶性壳聚糖浓度的增加，水溶性壳聚糖分子链由舒展链结构自聚转变为单链线团结构，单链线团结构进一步转变为相互缠绕的线团结构。在0.1 mmol/L的稀盐酸中，水溶性壳聚糖乙酰基水解速率与水溶性壳聚糖的解聚速率基本相等。而在12.08 mmol/L的浓盐酸中，水溶性壳聚糖的解聚速率是水溶性壳聚糖乙酰基水解速率的十倍还多。
　　水溶性壳聚糖的活性吸附中间是表面自由氨基，许多无机酸、有机酸和酸性化合物，甚至两性化合物，都能被水溶性壳聚糖吸附结合。水溶性壳聚糖吸附低浓度游离酸的过程遵循甲分子层机制进行。吸附速度随着吸附介质的介电常数的减小而减慢。水溶性壳聚糖一般不溶于碱，但当甲壳素在均相条件下脱乙酰基或者将高度脱乙酰化的水溶性壳聚糖在均相介质中进行乙酰化反应，当乙酰化度在百分之50左右时，获得的水溶性产物能溶于碱性条件。